놀라운 스피드의 소유자 볼트부터 맥스, 새미, 루시까지 최강의 전사 미니특공대는 ‘맹수 파워’로 한층 더 강력해진다. 신입 원숭이 대원, 재키가 합류해 활기를 더해가던 중, 외계 군단이 동물 세계를 넘어 지구까지 혼란에 빠뜨리기 시작하는데...

과연, 미니특공대는 강력해진 외계 군단에 맞서 위기에 처한 지구를 지켜낼 수 있을까?